如何使用protparam分析蛋白理化性质

如何使用protparam分析蛋白理化性质

科研者们是不是往往需要对新得到的蛋白的理化性质进行分析，以进行下一步实验，而这类软件十分常见，下面我就给大家介绍protparam如何操作进行蛋白的分析。

打开protparam：只要在百度里面搜索protparam，然后点击进入官网即可：在这不得不感叹万能的百度~~~~

有以下说明：ProtParam(参考文献/文档)是一种工具，它可以计算存储在Swiss-Prot或TrEMBL中的给定蛋白或用户输入的蛋白序列的各种物理和化学参数。计算参数包括分子量、理论pI、氨基酸组成、原子组成、消光系数、估计半衰期、不稳定性指数、脂肪族指数和亲水性(肉汁)总平均值(免责声明)。

然后是输入你所要弄得序列：这里有两种，一种是如果分析的是Swiss-Prot或TrEMBL数据库中的序列，则只要输入Swiss-Prot或TrEMBL的AC号，即accession number

另一种是新序列分析，这是你只要在如图所示的框中输入你的氨基酸序列，记住是氨基酸序列，而不是碱基序列喔。

以输入新序列为例，如下图粘贴序列，然后点击“compute parameters”后他就会自动进行估算。

如下图所示，分析得出的结果界面包含了该蛋白质的很多理化性质，如分子质量、等电点、氨基酸组成、原子组成、消光系数、半衰期、不稳定系数等等。

值得注意的是若不稳定系数大于40则不稳定，小于40则稳定。